Řízení vedené před správním soudem je vedeno podle zákona č. 150/2002 Sb., soudní řád správní, a má svá velmi přísná pravidla. Porušením přísných pravidel řízení se může daňový subjekt zbavit své šance na projednání sporu soudem. 



V řízení před správním soudem mnohonásobně platí již zmiňované pravidlo o síle argumentace. 



Proto je nezbytné svěřit zastoupení v řízení před soudem odborníkům, a to lhostejno zda z kanceláře UNTAX, s.r.o. nebo jiným specialistům. Osoba, jež nemá zkušenosti s tímto druhem řízení, má jen velmi malé šance uspět.



V řízení před soudem se lze bránit proti nezákonnému rozhodnutí ve věci samé, proti nečinnosti správního orgánu a proti nezákonnému zásahu, pokynu či donucení. 



Pakliže je daňový subjekt přesvědčen, že soud rozhodl chybně, lze rozsudek napadnout kasační stížností podle ust. § 102 a násl. zákona č. 150/2002 Sb., soudní řád správní.